Laima slimības ierosinātāja Borrelia burgdorferi paralogās gēnu ģimenes PFam12 proteīnu strukturāls un funcionāls raksturojums, lai noteiktu to lomu Laima slimības patoģenēzē
Sākums: 01/2022 Noslēgums: 12/2024
Projekta numurs
lzp-2021/1-0068
Finansējums
300 000 EUR
Projekta vadītājs
Kalvis Brangulis kalvis@biomed.lu.lv
Projektu īsteno
Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs
Zinātnes nozare
Medicīniskā biotehnoloģija; Medicīnas bāzes zinātnes, tai skaitā farmācija
Kopsavilkums
Laima slimība ir izplatīta ērču pārnēsāta infekcija, ko izraisa spiroheta Borrelia burgdorferi, kas nonāk jaunajā saimniekorganismā inficētas Ixodes ērces barošanās laikā. Tā ir izplatītākā ērču pārnēsātā infekcijas slimība Eiropā un ASV. Laima slimības ierosinātāja pētījumos īpaša uzmanība tiek pievērsta ar membrānu saistītajiem lipoproteīniem, jo tiem ir potenciāli svarīga loma mijiedarbībā ar saimniekorganismu un infekcijas nodrošināšanā. Mūsu nesen veiktie pētījumi ļāvuši mums identificēt, ka ārējās virsmas lipoproteīni, kas pieder divpadsmitajai paralogajai gēnu ģimenei (PFam12 - BB0844, BBG01, BBH37, BBJ08 un BBK01) spēj saistīt DNS ar augstu afinitāti un potenciāli tiem ir svarīga loma biofilmas izveidē un Laima slimības nodrošināšanā. Mūsu projekta mērķis ir visaptveroši izpētīt PFam12 proteīnu funkcionālās un strukturālās īpašības, lai noteiktu šo proteīnu lomu Laima slimības patoģenēzē un biofilmas izveidē. Dažas no metodēm, kas tiks izmantotas pētījuma gaitā ietver rentgenstaru kristalogrāfiju atsevišķu proteīnu un proteīnu-DNS kompleksu 3-d struktūru noteikšanai; elektroforēzes mobilitātes nobīdes tests un konkrētu PFam12 proteīnu atlikumu nomaiņa PFam12 proteīnu-DNS saistīšanās raksturošanai; B. burgdorferi PFam12-iztrūkstošu mutantu izveide un to ietekmes noteikšana gan uz infekcijas gaitu peļu modeļos, gan uz biofilmu veidošanos. Paredzams, ka PFam12 proteīnu strukturāls un funkcionāls raksturojums sekmētu jaunas stratēģijas izveidi cīņai ar Laima slimību
Projektu konkurss:
Fundamentālo un lietišķo pētījumu projektu 2021. gada atklātais konkurss