Sākums: 01.01.2026 Noslēgums: 31.12.2028
- Projekta numurs
- lzp-2025/1-009
- Finansējums
- 300 000 EUR
- Projekta vadītājs
- Anete Borodušķe
- Projektu īsteno
- Latvijas Universitāte
- Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs
- Rīgas Tehniskā universitāte
- Latvijas Universitāte
Zinātnes nozaru grupa: Lauksaimniecības, meža un veterinārās zinātnes
- Projekta pamata zinātnes nozare: Lauksaimniecības biotehnoloģija
- Papildu zinātnes nozare: Bioloģija
- Viedās specializācijas joma: Zināšanu-ietilpīga bioekonomika; Biomedicīna, medicīnas tehnoloģijas, biofarmācija un biotehnoloģijas
Kopsavilkums:
Mikroorganismu kultūru kolekcijās glabātie resursi satur augstu biosintēzes potenciālu. Tomēr tas netiek pilnvērtīgi izmantots, jo liela daļa biosintēzes gēnu klasteru mikroorganismos ir neaktīvi standarta kultivēšanas apstākļos. Vienlaikus, endofītisko mikroorganismu izcilās biosintēzes spējas liek domāt, ka augu-mikroorganismu mijiedarbība varētu būt spēcīgs mikroorganismu sekundārā metabolisma virzītājspēks. Mēs izvirzām hipotēzi, ka kokultivācija ar augu šūnu suspensijām kalpos kā funkcionāls ierosinātājs, kas aktivēs biosintēzes potenciālu gan endofītos, gan ar augiem nesaistītās baktērijās.
Mūsu mērķis ir izzināt iespējas izmantot baktēriju un augu šūnu suspensiju kokultivāciju kā stratēģiju baktēriju biosintēzes gēnu aktivācijai.
Projekta uzdevumi:
• Izveidot Streptomyces coelicolor A3(2) biosintēzes gēnu promoteru - reportiergēnu bibliotēku un optimizēt kokultivācijas apstākļus,
• Izvērtēt kokultivācijas ietekmi uz baktēriju biosintēzes gēnu mutaģenēzi, izmantojot adaptīvās evolūcijas pieeju,
• Izvērtēt kokultivācijas ietekmi uz biosintēzes gēnu aktivāciju, izmantojot metabolomiku un transkriptomiku,
Projekts sniegs fundamentālas atziņas par biosintēzes gēnu aktivāciju un evolūciju, kā arī veicinās mikroorganismu kultūru kolekciju ilgtspējīgu izmantošanu.
Rezultāti: divas Q1/Q2 publikācijas, divi ziņojumi zinātniskās konferencēs, jauns projekta pieteikums, biosintēzes gēnu promoteru bibliotēka, multi-omikas datu kopas deponētas publiskos datu repozitorijos.
Projektu konkurss:
Fundamentālo un lietišķo pētījumu projektu 2025. gada atklātais konkurss